符文本身并不包含直接的负面效果或惩罚机制，玩家无需担心使用后会带来属性降低等直观的副作用。符文作为提供临时增益的重要道具，其设计初衷是为了帮助玩家在特定活动中提升效率，例如加速建造、研究、增强部队战力或提高采集速度。符文的使用存在一系列明确的规则和限制，如果未能正确理解并遵守这些规则，则会导致增益失效、资源浪费或战术失误，这可以被视为因操作不当而产生的间接副作用。掌握符文的正确使用方法是避免这些不利情况的关键。
符文系统最核心的限制在于其唯一激活规则。玩家在同一时间只能激活一枚符文的效果，当拾取或激活新的符文时，它会立即顶替并完全覆盖前一枚符文的效果。这意味着若玩家在拥有一个高价值增益符文时，不慎拾取了一个低价值或与当前目标不符的符文，将直接导致已生效的强力增益被移除。部队在持有增加攻击力的符文时，若误触了采集速度符文，宝贵的战斗加成就将被替换。这种覆盖是不可逆的，且不会同时保留多种效果，因此玩家必须时刻注意自己当前激活的符文类型，尤其是在地图上符文密集或多人争夺的区域，盲目拾取可能适得其反。
部分符文的生效条件具有严格的时序性，这是容易引发增益浪费的关键点。尤其是建造速度符文、研究速度符文以及训练速度符文，这类符文的增益效果无法回溯作用于已经开始的进程。如果玩家先开启了某项耗时漫长的科技研究或建筑升级，然后再去拾取对应的加速符文，那么该符文对此项已开始的任务完全无效。正确的流程必须是先派遣部队采集到符文并使其生效后，再开始进行相应的建造或研究项目，否则符文的加速效果就白白浪费了。这一机制要求玩家在规划重要升级或研究前，必须提前侦察并获取相关符文，对行动的计划性提出了较高要求。
符文的临时性本质也带来了时机把握的风险。所有刷新在地图上的符文都不会永久存在，它们在一段时间后便会消失并重新化为圣坛守护者。这意味着玩家发现的符文增益是一个稍纵即逝的机会。如果因行军路线规划不合理、部队派遣不及时，或者单纯因犹豫而错过了采集时机，那么潜增益就会直接损失。尤其在争夺激烈的战斗区域或关键资源点，一个重要的攻击或防御符文可能被他人拾取，这不仅使自己失去了增强机会，也可能变相加强了对手。对符文刷新点的关注和快速的决策行动，是最大化其效益并避免错过即损失这一副作用的重要环节。
符文增益的获取并非毫无代价，它隐性地消耗了玩家的时间和部队行动机会。派遣部队前往采集符文需要时间，在紧张的战斗筹备或资源采集期，这可能会分散军事力量或影响采集效率。尤其是在符文距离城市较远或位于危险区域时，采集行动本身可能使部队暴露在风险之中。由于高级符文往往由强大的圣坛守护者守卫，击败它们需要消耗行动力并可能造成兵力损伤，这部分消耗可以看作是为了获取增益而付出的直接成本。如果未能权衡好收益与成本，例如花费大量行动力去获取一个短期用处不大的低级符文，从资源管理的角度看就是一种效益为负的操作。
不同类型的符文对应截然不同的游戏活动，错误的选择会导致增益与当前行动完全错配，从而产生零收益甚至负收益的情况。在集结部队准备进行大规模野战前，如果激活了资源产量提升或采集速度加成的符文，那么对即将发生的战斗毫无帮助，相当于在关键时期携带了一个无效增益。反之，在和平发展专注采集资源时，携带部队攻击或行军的符文也无法提升采集效率。玩家需要根据自己接下来一段时间的主要活动目标，主动地、有选择地寻找并激活对应类型的符文，避免因增益类型错配而导致的机会损失，这也是从策略层面规避符文使用不当副作用的重要思维。
