实力最强的角色通常集中在六道级和超影级层次。大筒木辉夜作为忍界创世之神，拥有白眼和轮回写轮眼两大瞳术，能够操控血继网罗黄泉比良坂和天之御中，是游戏中的终极BOSS级存在。她的技能不仅破坏力惊人，还附带无解的控制效果，属于必须团队配合才能挑战的顶级角色。六道仙人羽衣作为辉夜长子，继承了母亲的力量并自创六道仙法，成为首位十尾人柱力，其轮回眼和阴阳遁技能在游戏中能实现攻防一体，综合实力仅次于辉夜。
宇智波斑和六道带土是玩家可操作角色中的天花板。斑在复活后开启轮回眼和轮墓边狱，配合木遁与仙术查克拉，技能范围覆盖全场且伤害极高。带土成为十尾人柱力后获得求道玉和六道模式，神威的时空忍术结合阴阳遁，能打出爆发连招。这两位角色的操作难度较高，但熟练后几乎能单刷高难度副本。漩涡鸣人和宇智波佐助作为主角，在游戏后期解锁六道模式与阴阳之力，鸣人的仙法·超尾兽玉螺旋手里剑和佐助的完全体须佐能乎·因陀罗之矢都是清屏神技，适合中高阶玩家使用。
千手柱间和宇智波鼬属于经典强势角色。柱间的仙法木遁·真数千手具有全游戏最高的单体伤害，而鼬的月读和天照能实现无缝控制，万花筒写轮眼的幻术特效还能干扰对手操作。晓组织的长门（佩恩）凭借轮回眼技能地爆天星和万象天引，在PVP模式中表现突出，但需要精准预判技能释放时机。这些角色虽然不属于六道层级，但综合性能均衡，适合新手过渡或老手开发战术。
最大化发挥角色实力，培养策略很关键。六道级角色需要优先升级奥义技能和专属装备，比如辉夜的共杀灰骨和羽衣的六道·地爆天星必须满级。对于斑、带土等依赖查克拉的角色，建议搭配增加查克拉恢复的秘卷或辅助忍者。鸣人、佐助这类成长型角色则需均衡提升攻防属性，早期侧重螺旋丸和千鸟的强化，后期转型为六道模式后重点培养尾兽玉和须佐能乎。
辉夜的天之御中适合开场控场，接黄泉比良坂打位移伤害；斑的轮墓边狱可先手压制，配合树界降临实现连击；带土的神威突进后接阴阳遁爆发能秒杀脆皮。团队副本推荐搭配纲手或小樱提供治疗，而PVP模式中佐助的天手力加鸣人的影分身骚扰是不错的组合。再强的角色也需要合理操作，多练习技能衔接和走位才能成为真正的高手。
